박물관의 중요한 학술 활동의 하나로 유적지 발굴조사를 실시하고 있다.
그 동안에 건국대학교 박물관에서 있었던 발굴조사활동을 보면 다음과 같다.
| 1978년 | 경기도 가평군 이곡리 초기철기시대 주거지 (住居址: 집터) 발굴조사 |
|---|---|
| 1979,81년 | 경기도 연천군 전곡리 구석기시대 유적 연합발굴조사 |
| 1989,92년 | 경기도 연천군 남계리 구석기시대 유적 발굴조사 |
| 1993,94년 | 충북 충주시 단월동 고분군(古墳群) 발굴 조사 |
| 1996,97,98,99년 | 경기도 연천군 원당리 구석기시대 유적 발굴조사 |
| 1996,97,98년 | 충남 연기군 월산산업단지 부지내 문화유적 발굴조사 |
| 1997,98년 | 경남 진주 남강댐 수몰예정지역내 문화유적 발굴조사 |
| 1997년 | 경북 문경시 쌍룡계곡 개발지구내 문화유적 지표(地表)조사 |
| 1997년 | 경기도 광주군 관음리 주택신축부지내 문화유적 시굴(試掘)조사 |
| 1997년 | 경기도 광주군 학동리 창고신축부지내 문화유적 시굴조사 |
| 1997년 | 충북 충주시 호암동 건국대 병원신축부지내 문화유적 지표조사 |
| 1998년 | 경기도 광주군 오전리 주택신축부지내 문화유적 시굴조사 |
| 1998년 | 경기도 광주군 산성리 숭렬전(崇烈殿) 경내 건물지 시굴조사 |
| 1998년 | 인천시 인천지방법원 청사사신축부지내 문화유적 시굴조사 |
| 1998년 | 경기도 광주군 학동리 창고신축부지내 문화유적 시굴조사 |
| 1999년 | 충남 연기군 월산산업단지 진입도로부지내 문화유적 발굴조사 |
| 1999년 | 경기도 화성군 도로종합연구원 건립부지내 문화유적 발굴조사 |
| 2000년 | 경기도 고양시 식사동 아파트건설예정부지 외 6건 문화유적 지표조사 |
| 2001년 | 경기도 고양시 식사동 아파트건설예정부지 외 5건 문화유적 지표조사 |
| 2002년 | 경기 고양시 신일산 동문주택조합아파트예정부지 외 5건 문화유적지표조사 |
| 2003년 | 경기 용인 동백 동문주택조합아파트예정부지 외 12건 문화유적 지표조사 |
| 2004년 | 서울 성수동 서울 숲 조성사업예정부지 외 9건 문화유적 지표조사 |
| 2005년 | 경기 의왕 내손동 재건축예정부지 외 11건 문화유적 지표조사 |
| 2006년 | 서울여자대학교 부지 외 11건 문화유적 지표조사 |
| 2007년 | 서울 종로 옥인 제1구역 재개발 예정부지 외 10건 문화유적 지표조사 |
이들 발굴및 시굴조사의 출토 유물들은 문화재보호법에 따라 국가 귀속및 위탁 보관 협약절차를 거친 후 대부분 건국대학교 박물관 선사유물 전시실에 전시되어 있는데, 특히 가평군 이곡리 출토 유물과, 경기도 연천군 일대 구석기 출토 유물들은 이분야 학술 연구에 매우 중요한 자료들로 평가받고 있다.
건국대학교 박물관 발굴조사 관련 발굴보고서는 한국학술정보원 KISS에서 열람 가능합니다. 